La Secretaría General, por delegación, tiene como principales misiones las competencias y facultades que la legislación vigente atribuye al Rector, los Estatutos de la Universidad y las disposiciones concordantes y complementarias en relación con la firma de certificados, la suscripción de contratos o convenios  y la gestión de la seguridad y archivo de la documentación generada por la universidad, así como el ámbito económico y el desarrollo estatutario y normativo.

Las funciones principales de la Secretaria General son:

• Ostentar la custodia de los Registros y Archivos de la Universidad.
• Redactar y custodiar las actas de los órganos colegiados en los que ejerce de secretaria, así como la expedición de las certificaciones que correspondan.
• Redactar la memoria anual de las actividades de la Universidad Miguel Hernández de Elche.
• Expedir todas las certificaciones que se deban de emitir por la Universidad y presentar ante entidades públicas o privadas, de acuerdo con lo que conste en los registros oficiales de la UMH y visadas por el Rector.
• Remitir, por orden del Rector, los expedientes solicitados por la jurisdicción contencioso administrativa, tras su revisión por los servicios jurídicos de la Universidad.
• Dar fe pública en todo el ámbito de la Universidad.
• Velar, en coordinación con el Gerente, por el cumplimiento de todos los términos formales derivados de la aplicación de los Estatutos y del Reglamento de Gobierno, Representación y Administración de la UMH, que por su incumplimiento puedan entorpecer el normal funcionamiento de la Universidad u originarle responsabilidades ante los miembros de la comunidad universitaria o ante terceros.
• La publicación del BOUMH, que se hará en soporte electrónico, será responsabilidad de la Secretaria General de la Universidad, de acuerdo con el Reglamento del Boletín Oficial de la UMH, procurando además que las normas dictadas por órganos externos a la UMH y publicadas en sus correspondientes boletines se publiquen en él, con el único fin de darles publicidad.
• La recopilación, archivo y seguridad de los datos y documentación de la universidad, incluyendo el archivo de los convenios con otras universidades, empresas e instituciones u organismos públicos o privados.
• El desarrollo estatutario y normativo de la Universidad.
• La firma, a los efectos de la expedición, de los certificados supletorios de títulos académicos oficiales de los centros adscritos a la Universidad Miguel Hernández de Elche, incluidos los de doctorado.
• La facultad de autorizar y disponer los gastos, y también de ordenar pagos dentro del ámbito de sus competencias.
• La suscripción, en nombre de la Universidad Miguel Hernández de Elche de contratos, convenios, o pactos en materias de su competencia.